Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r196Q5SVD5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms