Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sft2d1Q5SSN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms