Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms