Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Trim58Q5NCC9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Trim58Q5NCC9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim58Q5NCC9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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