Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim41Q5NCC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim41Q5NCC3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms