Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps41Q5KU39 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps41Q5KU39 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms