Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp36l3Q5ISE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp36l3Q5ISE2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp36l3Q5ISE2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms