Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Taf3Q5HZG4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms