Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SynaQ5G5D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms