Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms