Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prune2Q52KR3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms