Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rtl6Q505G4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl6Q505G4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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