Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srek1ip1Q4V9W2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms