Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc3lQ4KL14 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc3lQ4KL14 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms