Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Snx25Q3ZT31 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx25Q3ZT31 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx25Q3ZT31 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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