Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca4bQ3UW98 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca4bQ3UW98 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms