Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr1d1Q3UV55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms