Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms