Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd27Q3UMR0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms