Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upf3bQ3ULL6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upf3bQ3ULL6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms