Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK8

Tnrc6a, Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,896 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6aQ3UHK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnrc6aQ3UHK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnrc6aQ3UHK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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