Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms