Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip13Q3UA06 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip13Q3UA06 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms