Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cops9Q3U898 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms