Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf180Q3U827 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rnf180Q3U827 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Rnf180Q3U827 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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