Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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