Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms