Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc136Q3TVA9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc136Q3TVA9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms