Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTL0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms