Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calr4Q3TQS0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms