Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms