Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gtf3c3Q3TMP1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms