Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms