Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam107bQ3TGF2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms