Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q149G0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q149G0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q149G0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q149G0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q149G0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms