Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Perm1Q149B8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Perm1Q149B8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms