Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4r2Q0VGB7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r2Q0VGB7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms