Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab42Q0PD08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab42Q0PD08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms