Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms