Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc7a1Q09143 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc7a1Q09143 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms