Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms