Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gata4Q08369 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms