Protein–RNA interactions for Protein: Q08122

Tle3, Transducin-like enhancer protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle3Q08122 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle3Q08122 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tle3Q08122 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms