Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms