Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmbpQ07456 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AmbpQ07456 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms