Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Fmn1Q05860 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms