Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SryQ05738 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SryQ05738 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SryQ05738 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SryQ05738 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SryQ05738 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms