Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox13Q04891 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms