Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox12Q04890 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms