Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Emx2Q04744 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms